Програми ЕКЗ відрізняються між собою тільки медикаментами, за допомогою яких проводять стимуляцію яйників. Вибір програми ЕКЗ фактично не залежить від фактору безпліддя. Він знаходиться у прямій залежності від оваріального резерву жінки (запасу яйцеклітин у яйниках) та її віку. Додатково беруть до уваги гінекологічні та екстрагенітальні захворювання жінки.